产品货号:
YTB3013
中文名称:
BalbRT Q M-MLV反转录酶
英文名称:
BalbRT Q M-MLV reverse transcriptase
产品规格:
10kU|50kU|200kU
发货周期:
1~3天
产品价格:
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本制品是一种经过改造和优化特别适合定量PCR(qPCR)的高精确度反转录酶。BalbRT Q M-MLV反转录酶具有正常的依赖于RNA或DNA模板的DNA聚合酶活性,能够以RNA或DNA为模板,在引物存在的情况下进行互补DNA链的合成,即可以进行cDNA的第一链合成。同时本反转录酶还保留了RNase H活性,能选择性剪切RNA和DNA杂合双链中的RNA,有利于后续cDNA第二链的合成。
本制品是最常用的优质反转录酶之一,广泛用于获得总RNA或mRNA后cDNA第一条链的合成,特别适合用于qPCR和一步法的qRT-PCR,本制品的反转录产物也适合用于常规的PCR、cDNA的第二链合成以及cDNA文库的构建,以及逆转录所得目的基因的克隆等。BalbRT Q M-MLV反转录酶还可以通过反转录用于DNA探针的荧光、生物素、地高辛或同位素标记等,也可以通过引物延伸来分析和研究RNA。
本制品反转录性能优、检测灵敏度高、扩增特异性强、反应稳定性好,不仅非常适合用于常规的RNA样品的反转录和qPCR检测或一步法qRT-PCR检测,也非常适合于內源低丰度RNA、外源病毒RNA等微量RNA的反转录及后续的qPCR检测。
大肠杆菌表达纯化的经过优化改造的M-MLV反转录酶。
一个活性单位是指以poly(A)·oligo(dT)12~18为模板引物,37℃条件下,10min内将1nmol的dTTP掺入酸性不溶物所需的酶量。
反应缓冲液:50mM Tris-HCl(pH8.3),75mM KCl,3mM MgCl2,10mM DTT,0.5mM [3H]-dTTP,0.4mM polyA·oligo(dT)12~18。
组分 | 10kU | 50kU | 200kU |
BalbRT Q M-MLV反转录酶(200U/μL) | 50μL | 250μL | 1mL |
5×Reaction Buffer | 300μL | 1.2mL | 5mL |
保存:-20℃
20mM Tris-HCl(pH7.5),150mM NaCl,0.1mM EDTA,1mM DTT,0.01%(v/v) NP-40 and 50%(v/v) glycerol。
不含DNA内切酶、外切酶和磷酸酯酶和RNA酶,可以满足常规反转录合成cDNA第一条链等的需要。
- 80℃孵育10分钟可以导致BalbRT Q M-MLV反转录酶失活;
- EDTA、EGTA等螯合剂、无机磷酸盐或焦磷酸盐以及聚氨(polyamine)对BalbRT Q M-MLV反转录酶有抑制作用。
- 对于GC含量比较高的RNA的反转录,产品的使用说明中给予了特别说明,请予以关注。
- 本制品仅限于专业人员的科学研究用,不得用于临床诊断或治疗,不得用于食品或药品。
- 为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。
利用BalbRT Q M-MLV反转录酶对总RNA进行反转录,之后以不同稀释倍数的cDNA为模板,通过qPCR检测目的基因的结果请参考图1。
图1.BalbRT Q M-MLV反转录酶对总RNA进行反转录后用于qPCR检测的效果图。从HEK293T细胞抽提获得的总RNA 2μg,在20μL反转录体系(2μg Total RNA,0.5μg Oligo(dT)18 primer,0.2μg Random Hexamer primer,1×Reaction Buffer,20U RNase Inhibitor,dNTP Mix (1mM each),200U BalbRT Q M-MLV反转录酶)中进行反转录,反转录后取1μL (100%)或不同稀释比例(1μL的10%、1%、0.1%、0.01%)反转录产物进行GAPDH cDNA 151bp目的片段的qPCR扩增和电泳检测。A.扩增曲线图。B.溶解曲线图。C.qPCR扩增产物的电泳图。NTC (no-template control),用水代替反转录产物。qPCR反应体系20μL,使用荧光定量PCR反应预混液(SYBR Green I)。实际检测效果会和特定实验条件有关,图中结果仅供参考。
- cDNA第一条链的合成:
- 参考如下表格中设置的20μL反转录体系(RNase抑制剂和25mM dNTP混合液可从百奥莱博订购):
成分 用量 模板(右侧3种任选其中一种) Total RNA 0.1ng~5μg 或poly(A) RNA/mRNA 10pg~0.5μg 或specific RNA 0.01pg~0.5μg 引物(右侧3种任选其中一种) Oligo(dT)18 primer 0.5μg(或100pmol) 或Random Hexamer primer 0.2μg(或100pmol) 或gene-specific primer 15-25pmol DEPC-treated Water 至13.7μL 选择性步骤:如果模板RNA的GC含量较高(例如大于55%)或者有比较严重的二级结构,混匀后微离心以把液体沉降至管底,65℃孵育5min,随后立即置于冰上冷却,以打开RNA中一些比较稳定的二级结构。 5×Reaction Buffer 4μL RNase Inhibitor(40U/μL) 0.5μL dNTP Mix(25mM each) 0.8μL BalbRT QM-MLV反转录酶 1μL 总体积 20μL - 轻轻混匀(用移液器轻轻吹打混匀或用涡旋混合器在最低速度轻轻混匀),随后离心沉淀液体。
- 如果使用Oligo(dT)18或基因特异性引物,42℃孵育10~60min。如果使用random hexamer(随机六聚体)作为引物,先在25℃孵育10min,随后在42℃孵育10~60min。反转录3kb以下的cDNA,反转录10min即可,反转录3~6kb的cDNA,反转录30min即可,而6kb以上的cDNA推荐反转录60min。当使用random hexamer(随机六聚体)作为引物,并且后续用于qPCR时,后续检测任何长度的基因,均反转录10min就足够了。
- 80℃孵育10min以失活BalbRT Q M-MLV反转录酶并终止反转录反应。
- 对于5kb以上的长片断cDNA不推荐采用加热的方法失活反转录酶,该方法易导致部分长片断DNA被剪切,此时可考虑酚氯仿抽提或柱纯化方法。
- 反转录产物可以直接用于后续的PCR反应等,也可以-20℃冻存以备以后使用。用于后续PCR反应时,如果PCR的反应体系为20μL和50μL,则推荐相应地使用0.8μL和2μL反转录产物。
- 参考如下表格中设置的20μL反转录体系(RNase抑制剂和25mM dNTP混合液可从百奥莱博订购):
- qPCR检测:
- 推荐使用荧光定量PCR反应预混液(SYBR Green I)进行常规的荧光染料法qPCR检测,或者使用探针法qPCR MasterMix进行Taqman探针法qPCR检测。
- qPCR的具体条件,请参考qPCR试剂盒的相关说明。
- 推荐使用荧光定量PCR反应预混液(SYBR Green I)进行常规的荧光染料法qPCR检测,或者使用探针法qPCR MasterMix进行Taqman探针法qPCR检测。
- 引物延伸、探针标记等其它用途请自行参考M-MLV反转录酶的相关文献资料进行。
- 总RNA反转录产物电泳观察不到。
- 反转录产物由于是从模板反转录而获得,而模板的量本身比较低,反转录的量通常还要少于模板量,并且总RNA的反转录产物大小很不均匀,因此通常总RNA的反转录产物直接电泳观察是观察不到的。
- 反转录产物通过PCR扩增没有特异性条带。
- PCR扩增没有获得特异性条带时建议先使用actin、GAPDH等作为内参进行PCR扩增,看是否可以成功扩增。如果可以成功,则说明PCR扩增体系没有问题,此时通常是目的基因的引物设计欠佳,当然也有可能是反转录产物质量欠佳。如果内参不能被很好地扩增,则有可能PCR体系存在问题或反转录产物质量欠佳。
- 模板RNA发生了降解。哺乳动物细胞或组织的总RNA琼脂糖电泳后应该可以看到清晰的18S和28S rRNA条带,并且28S rRNA和18S rRNA的亮度比例应该大于等于2.0。如果比例小于2.0,则提示总RNA发生了显著的降解,最好能重新制备总RNA样品。避免RNA降解的主要方法是,严格进行RNA的相关操作,包括带洁净手套、戴一次性口罩、在洁净环境中抽提或制备RNA,以尽量避免RNase污染。
- 模板RNA的纯度偏低。在提取纯化RNA的过程中,残留在溶液中的一些成分如苯酚、SDS、EDTA、胍盐、磷酸、焦磷酸、多胺、亚精胺等会抑制反转录酶活性。对RNA样品进行柱纯化,或者进行沉淀、洗涤和再溶解,通常可以有效去除残留的污染物。通常选择使用百奥莱博的BalbZol或Trizol抽提获得的总RNA完全可以满足反转录反应的需要。
- 反转录反应的模板量不足。在抽提获得总RNA后,在进行一些精细的定量检测时通常会进行DNase I消化,以充分去除可能的残留的DNA的干扰。DNase I进行热失活时,需要加入EDTA至终浓度为2.5mM,否则RNA在没有螯合剂的情况下,在加热过程中容易被水解,从而导致模板量不足。此外,扩增特定基因时,需要先查询该基因的组织分布特点,利用其高表达的组织进行目的基因的反转录和克隆。用该基因丰度极低的组织或细胞样品进行反转录和PCR扩增,通常会由于模板量过少而PCR扩增失败。
- 没有使用适当的反转录引物。对于细菌RNA和不含poly(A)尾巴的RNA,要用random hexamer引物代替Oligo(dT)18引物。使用基因特异性反转录引物时,需要确保基因特异性引物设计合理正确。
- PCR扩增没有获得特异性条带时建议先使用actin、GAPDH等作为内参进行PCR扩增,看是否可以成功扩增。如果可以成功,则说明PCR扩增体系没有问题,此时通常是目的基因的引物设计欠佳,当然也有可能是反转录产物质量欠佳。如果内参不能被很好地扩增,则有可能PCR体系存在问题或反转录产物质量欠佳。
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